Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NCOA4Q13772 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms