Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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ATRQ13535 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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