Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LINC00520-206ENST00000560336 883 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SATB1-AS1-212ENST00000596152 610 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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MKRN4PQ13434 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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MKRN4PQ13434 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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MKRN4PQ13434 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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MKRN4PQ13434 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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MKRN4PQ13434 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MKRN4PQ13434 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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