Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RPA4Q13156 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms