Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PTP4A2Q12974 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTP4A2Q12974 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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