Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB40BQ12829 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms