Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL9Q07325 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms