Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERCC6Q03468 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERCC6Q03468 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms