Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCNT1Q02742 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms