Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms