Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BRCA2P51587 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms