Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms