Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AFMP43652 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AFMP43652 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AFMP43652 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AFMP43652 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AFMP43652 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms