Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC8A1P32418 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms