Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CD40LGP29965 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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