Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SDSP20132 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDSP20132 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDSP20132 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDSP20132 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDSP20132 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDSP20132 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDSP20132 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SDSP20132 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SDSP20132 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SDSP20132 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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