Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSLP07711 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSLP07711 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTSLP07711 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms