Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CYBBP04839 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CYBBP04839 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms