Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TOP3BO95985 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TOP3BO95985 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms