Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CREB3O43889 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms