Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PCH4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PCH4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PCH4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PCH4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PCH4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms