Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
XIRP2A4UGR9 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms