Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TRAPPC4Q9Y296 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms