Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZNRF3Q9ULT6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZNRF3Q9ULT6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms