Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms