Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms