Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TMEM208Q9BTX3 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TMEM208Q9BTX3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms