Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RTKNQ9BST9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms