Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms