Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GATA6Q92908 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA6Q92908 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms