Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms