Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEMA6DQ8NFY4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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