Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TMIEQ8NEW7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TMIEQ8NEW7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TMIEQ8NEW7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIEQ8NEW7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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TMIEQ8NEW7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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TMIEQ8NEW7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TMIEQ8NEW7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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TMIEQ8NEW7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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TMIEQ8NEW7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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