Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC117Q8IWD4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms