Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC50Q8IVM0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms