Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms