Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STRCQ7RTU9 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms