Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC141Q6ZP82 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC141Q6ZP82 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms