Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM72Q6ZMU5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms