Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms