Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMA3Q16787 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms