Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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