Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ZNF239Q16600 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ZNF239Q16600 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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