Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
R3HDM1Q15032 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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