Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRCAPQ14761 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms