Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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FAM53BQ14153 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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FAM53BQ14153 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FAM53BQ14153 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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