Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RASGRF1Q13972 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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