Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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GTF2H3Q13889 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2H3Q13889 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms