Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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TUBA3CQ13748 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TUBA3CQ13748 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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