Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PEX6Q13608 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PEX6Q13608 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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